Alexis Kohler est diplômé de l'Institut d'études politiques de Paris et de l’ENA.
Il commence son parcours professionnel dans la haute fonction publique où il y occupe le poste d’administrateur civil au sein de la direction générale du Trésor à Bercy.
Il a été par la suite détaché dans divers organismes, notamment au Fonds monétaire international, puis à l’Agence des participants de l’État dont il a été le sous-directeur de 2010 à 2012.
Sous la présidence de François Hollande, Alexis Kohler, occupe le poste de directeur adjoint au cabinet de Pierre Moscovici alors ministre de l’Économie et des Finances.
Depuis mai 2017, il est Secrétaire Général de l'Élysée sous la présidence d'Emmanuel Macron.
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